全州各县(市)城市县级集中式饮用水水源地分别为阿图什市水源地、阿克陶县毛达湾水厂、阿合奇县老城区水厂地下水水源地、乌恰县康苏水库地表水水源地等4个水源地有数据,水质状况总体为优。Ⅰ~Ⅲ类达标水质水源地比例为100.0%;不达标水质水源地比例为0%。